Resultados de portador para duas pessoas

O significado de um resultado de portador

A maior parte das doenças hereditárias do nosso painel de portador é recessiva. Uma pessoa com uma cópia alterada do gene é portadora e quase sempre saudável. Uma criança só é afetada quando herda uma cópia alterada de cada um dos pais.

Quando as duas pessoas têm variantes no mesmo gene

Imagine um casal em que as duas pessoas têm uma variante no mesmo gene. Quando duas pessoas portadoras da mesma doença recessiva têm filhos, cada gravidez tem uma probabilidade de uma em quatro de a criança herdar as duas variantes. É um padrão a levar a uma consulta de aconselhamento genético antes de uma gravidez, e não um resultado sobre uma criança concreta.

Porque pesa mais em algumas famílias

As populações fundadoras têm os seus próprios conjuntos de doenças recessivas. A Finlândia tem o património finlandês de doenças (Finnish Disease Heritage), dezenas de doenças muito mais frequentes na Finlândia do que noutros países. As famílias judias asquenazes têm também um conjunto bem conhecido, que inclui a doença de Tay-Sachs e a doença de Gaucher. O nosso painel de portador inclui genes dos dois conjuntos. Esse património não esgota o quadro finlandês: em 2024, o hospital universitário de Helsínquia (HUS) identificou 104 genes em que mais de 0,5% da população finlandesa é portadora, e só 26 deles pertencem a esse património. O nosso guia da pesquisa do estado de portador para casais explica quantos casais essa pesquisa identifica e o que o sistema público finlandês oferece.

Para além desse painel selecionado, cada relatório de genoma completo procura também as variantes que o ClinVar dá como causadoras de doença em mais 1 363 genes recessivos e ligados ao X, e a vista de casal compara-as também. Procura as variantes que o ClinVar lista, não genes inteiros, por isso encontra a maioria das pessoas portadoras de variantes bem conhecidas, mas não alguém cuja variante ainda não esteja listada.

• Aspartylglucosaminuria (AGU)
• Congenital chloride diarrhea (CCD)
• Congenital nephrosis, Finnish type (CNF)
• Cystic fibrosis
• Gaucher disease
• Niemann-Pick disease type A/B
• Non-syndromic hearing loss (DFNB1)
• Northern epilepsy (CLN8)
• Phenylketonuria (PKU)
• Salla disease
• Sickle cell & β-thalassemia
• Tay-Sachs disease
• Wilson disease

Até onde um ficheiro permite excluir uma doença

A comparação não é uma criança simulada, nem uma probabilidade para uma gravidez real, nem uma luz verde. Quando nenhum dos ficheiros tem uma variante num gene, a célula di-lo e indica se os ficheiros examinaram esse gene, o que é diferente de dizer que o casal está livre de variantes nesse gene.

Um gVCF ou as leituras alinhadas (BAM ou CRAM) podem provar que um gene foi examinado. Um VCF simples regista apenas as variantes que encontrou, por isso, para esses genes, a tabela diz «not examined», ou seja, não examinado. Um chip de genotipagem da 23andMe ou da AncestryDNA não consegue de todo alimentar o painel de portador.

Como funciona a vista de casal

1. Uma das duas pessoas abre a vista de casal na aplicação e convida a outra por e-mail. A outra ainda não precisa de conta: o convite permite-lhe criar uma, ou confirmar por e-mail, e nesse caso é quem convidou que acrescenta o ficheiro.
2. A outra pessoa aceita a partir da sua própria conta, ou confirma no link do e-mail. Antes disso nada é partilhado e nenhum ficheiro seu é lido, e aceitar não obriga a esperar pelo ficheiro.
3. Cada pessoa precisa de um ficheiro de genoma completo: uma pode acrescentar os dois, depois de a outra confirmar por e-mail. A tabela fica preenchida quando os dois estiverem analisados, e quem estava à espera recebe um e-mail.
4. As duas pessoas veem a mesma página: o número de genes em que pelo menos uma delas tem uma variante, o que cada um significa para o casal, o painel selecionado lado a lado e os genes da pesquisa alargada em que uma delas tem uma variante. Qualquer uma pode retirar a vista a qualquer momento, e ela desaparece para as duas.

Se as duas pessoas a ativarem, a página mostra também uma perspetiva do casal, assinalada como mera curiosidade: como se herdam algumas características inofensivas de um só marcador e o grupo sanguíneo ABO, a mistura média de origens de uma criança e uma calculadora de altura que usa as duas alturas medidas do casal. As alturas introduzidas não são guardadas. Quando os dois relatórios têm a pontuação de altura da categoria «Emerging research» (investigação emergente), calculada a partir de um gVCF que leu quase todas as suas variantes, a perspetiva mostra também o percentil de cada pessoa nessa pontuação e a pontuação esperada de uma criança, igualmente assinalada como investigação emergente. Qualquer uma das duas pessoas a pode desativar, e desaparece para ambas. Até que ponto duas alturas, e dois genomas, preveem a altura de uma criança.

Com o consentimento das duas pessoas, uma comparação à parte avalia o grau de parentesco entre os dois ficheiros, mostrado como uma faixa, nunca como um número nem como uma relação de parentesco com nome. Precisa de um gVCF de cada pessoa.

Sem a perspetiva do casal, a vista mostra apenas resultados de portador. Os resultados nos genes dominantes da pesquisa alargada, em que uma só cópia alterada pode causar uma doença, nunca aparecem nela. Um resumo do casal numa página, com todas as variantes e a respetiva classificação no ClinVar, fica disponível para imprimir ou guardar e levar a uma consulta de aconselhamento genético.