Trägerergebnisse für zwei Menschen

Die Bedeutung eines Trägerergebnisses

Die meisten erblichen Erkrankungen auf unserem Trägerpanel werden rezessiv vererbt. Wer eine veränderte Kopie des Gens hat, ist Träger und fast immer gesund. Ein Kind erkrankt nur, wenn es von jedem Elternteil eine veränderte Kopie erbt.

Wenn beide Partner dasselbe Gen tragen

Angenommen, Sie tragen beide eine Variante im selben Gen. Wenn zwei Träger derselben rezessiven Erkrankung ein Kind bekommen, besteht in jeder Schwangerschaft eine Wahrscheinlichkeit von einem Viertel, dass das Kind beide Varianten erbt. Dieses Muster ist ein Thema für eine genetische Beratung vor einer Schwangerschaft, kein Ergebnis über irgendein Kind.

Warum zählt es in manchen Familien mehr?

Gründerpopulationen haben ihre eigenen Gruppen rezessiver Erkrankungen. Finnland hat das finnische Krankheitserbe (Finnish Disease Heritage), Dutzende von Erkrankungen, die in Finnland weit häufiger sind als anderswo. Aschkenasisch-jüdische Familien haben eine bekannte eigene Gruppe, darunter die Tay-Sachs-Krankheit und Morbus Gaucher. Unser Trägerpanel enthält Gene aus beiden Gruppen. Das Krankheitserbe zeigt nicht das ganze Bild für Finnland: 2024 fand das Universitätsklinikum Helsinki (HUS) 104 Gene, in denen mehr als 0,5 % der Finninnen und Finnen Träger sind, und nur 26 davon gehören zum Krankheitserbe. Unser Leitfaden zum Trägerscreening für Paare erklärt, wie viele Paare ein Screening auffindet und was das öffentliche Gesundheitssystem in Finnland anbietet.

Über dieses kuratierte Panel hinaus sucht jeder Ganzgenom-Bericht auch nach den bekannten krankheitsverursachenden Varianten aus ClinVar in 1.363 weiteren rezessiven und X-chromosomalen Genen, und die Partneransicht vergleicht auch diese. Sie liest die Varianten, die ClinVar listet, keine ganzen Gene; sie findet also die meisten Träger bekannter Varianten und niemanden, dessen Variante noch nicht gelistet ist.

• Aspartylglucosaminuria (AGU)
• Congenital chloride diarrhea (CCD)
• Congenital nephrosis, Finnish type (CNF)
• Cystic fibrosis
• Gaucher disease
• Niemann-Pick disease type A/B
• Non-syndromic hearing loss (DFNB1)
• Northern epilepsy (CLN8)
• Phenylketonuria (PKU)
• Salla disease
• Sickle cell & β-thalassemia
• Tay-Sachs disease
• Wilson disease

Zu den Grenzen einer Datei

Der Vergleich ist kein simuliertes Kind, keine Wahrscheinlichkeit für eine echte Schwangerschaft und keine Entwarnung. Wo keine der beiden Dateien eine Variante in einem Gen trägt, sagt die Zelle das, und sie sagt auch, ob die Dateien dieses Gen untersucht haben; das ist etwas anderes als die Aussage, dass Sie beide unauffällig sind.

Eine gVCF oder alignierte Reads (BAM oder CRAM) können belegen, dass ein Gen gelesen wurde. Eine einfache VCF verzeichnet nur die Varianten, die sie gefunden hat, deshalb steht für diese Gene in der Tabelle „not examined“, also nicht untersucht. Ein Chip-Test von 23andMe oder AncestryDNA kann das Trägerpanel überhaupt nicht speisen.

So funktioniert die Partneransicht

1. Eine Person von Ihnen öffnet in der App die Partneransicht und lädt die andere per E-Mail ein. Die andere Person braucht dafür noch kein Konto: Mit der Einladung kann sie eines anlegen, oder sie bestätigt per E-Mail, damit Sie ihre Datei für sie hinzufügen können.
2. Die andere Person nimmt in ihrem eigenen Konto an oder bestätigt über den Link in der E-Mail. Vorher wird nichts geteilt und keine ihrer Dateien gelesen, und mit dem Annehmen muss sie nicht warten, bis ihre Datei da ist.
3. Jede Person braucht eine Ganzgenom-Datei; eine Person kann beide hinzufügen, sobald die andere per E-Mail bestätigt hat. Die Tabelle füllt sich, sobald beide ausgewertet sind, und wer gewartet hat, bekommt eine E-Mail.
4. Sie sehen beide dieselbe Seite: wie viele Gene es gibt, in denen mindestens eine Person von Ihnen eine Variante trägt, was jedes davon für Sie beide bedeutet, das kuratierte Panel nebeneinander und die Gene des erweiterten Screenings, in denen eine Person von Ihnen eine trägt. Jede Person kann die Ansicht jederzeit zurückziehen, und dann verschwindet sie für Sie beide.

Wenn Sie ihn beide einschalten, zeigt die Seite außerdem einen Paar-Ausblick, als reine Unterhaltung gekennzeichnet: wie einige harmlose Merkmale, die an einem einzelnen Marker hängen, und die AB0-Blutgruppe vererbt werden, die durchschnittliche Herkunftsmischung eines Kindes und einen Größenrechner, der Ihre beiden gemessenen Körpergrößen verwendet. Die eingegebenen Größen werden nicht gespeichert. Wenn beide Berichte den Größen-Score der Kategorie „Emerging research“ aus einer gVCF enthalten, die fast alle seiner Varianten gelesen hat, zeigt der Ausblick auch Ihre beiden Perzentile auf diesem Score und den erwarteten Score eines Kindes, ebenfalls als „Emerging research“ gekennzeichnet. Jede Person kann den Ausblick ausschalten, und dann verschwindet er für beide. Wie gut zwei Körpergrößen und zwei Genome die Größe eines Kindes vorhersagen.

Mit dem Einverständnis beider Partner ermittelt ein gesonderter Vergleich, wie eng die beiden Dateien miteinander verwandt sind, dargestellt als Stufe, nie als Zahl oder als benannte Verwandtschaftsbeziehung. Dafür braucht es von Ihnen beiden je eine gVCF.

Ohne den Paar-Ausblick zeigt die Ansicht nur Trägerergebnisse. Ergebnisse in den dominanten Genen des erweiterten Screenings, bei denen schon eine veränderte Kopie eine Erkrankung verursachen kann, erscheinen darin nie. Eine einseitige Übersicht über das Paar, mit jeder Variante und ihrem Status in ClinVar, können Sie für eine genetische Beratung ausdrucken oder speichern.