Glossar

Verständliche Erklärungen der Begriffe, die in Ihrem Bericht vorkommen. Sie beschreiben Konzepte und sind keine medizinische Beratung.

Der Bericht selbst ist auf Englisch. Deshalb steht jeder Begriff hier zuerst so, wie Sie ihn im Bericht lesen, und dahinter in Klammern das deutsche Wort.

Variant (Variante)

Eine Stelle, an der Ihre DNA-Sequenz vom Referenzgenom abweicht. Die meisten Varianten sind harmlos; einige wenige sind in der klinischen Fachliteratur untersucht.

Reference genome (Referenzgenom, GRCh38)

Die menschliche Standardsequenz der DNA, mit der die Daten aller Menschen verglichen werden, damit eine Position für alle dasselbe bedeutet. GRCh38 ist die aktuelle Version.

Zygosity (Zygotie)

Ob eine Variante auf einer Kopie eines Gens vorliegt (heterozygot, im Bericht heterozygous) oder auf beiden Kopien (homozygot, im Bericht homozygous). Bei rezessiven Erkrankungen entscheidet das darüber, ob jemand Träger ist oder selbst erkrankt.

Carrier (Träger)

Eine Person mit einer Kopie einer rezessiven Variante. Träger sind in der Regel selbst nicht betroffen, doch die Variante kann für die Familienplanung wichtig sein.

Pathogenic / Likely pathogenic (pathogen / wahrscheinlich pathogen, P/LP)

Die Einstufung von ClinVar für Varianten, die die Fachwelt als krankheitsverursachend oder wahrscheinlich krankheitsverursachend ansieht. Wir geben die Einstufung von ClinVar wieder und vergeben keine eigene.

Review status (Bewertungsstatus, Sterne)

Die Skala von ClinVar mit 0–4 Sternen dafür, wie eine Einstufung geprüft wurde. Ein Stern bedeutet, dass eine einzelne einreichende Stelle ihre Kriterien angegeben hat oder dass Einreichende mit angegebenen Kriterien uneins sind; zwei, dass mehrere übereinstimmen; drei, ein Expertengremium; vier, eine Praxisleitlinie; keiner, keine angegebenen Kriterien. Bewertet wird die Prüfung, nicht die Schwere der Erkrankung. Die Definitionen von ClinVar. Wie die Sterne ordnen, was ein Bericht zeigt: VUS, ClinVar-Sterne und warum sich ein genetisches Ergebnis ändern kann.

Penetrance (Penetranz)

Wie oft Menschen mit einer bestimmten Variante die zugehörige Erkrankung tatsächlich entwickeln. Hohe Penetranz bedeutet keine Gewissheit.

Allele frequency (Allelfrequenz)

Wie häufig eine Variante in der Bevölkerung ist (aus gnomAD). Sehr seltene Varianten werden anders behandelt als häufige.

Genome-wide significance (genomweite Signifikanz, p ≤ 5×10⁻⁸)

Die strenge statistische Hürde, die eine genomweite Assoziationsstudie (GWAS) nehmen muss, bevor sie einen Zusammenhang zwischen Variante und Merkmal als echt gelten lässt. Eine GWAS testet rund eine Million häufiger Varianten auf einmal; die übliche Schwelle p < 0,05 würde daher allein durch Zufall Zehntausende falscher Treffer liefern. Verteilt man diese 0,05 auf alle Tests, landet man bei etwa 5×10⁻⁸. Wird die Hürde genommen, ist der Zusammenhang sehr wahrscheinlich kein statistischer Zufall.

Below genome-wide significance (nicht genomweit signifikant)

Ein Ergebnis, das die Hürde von 5×10⁻⁸ nicht genommen hat. An dieser Stelle werden Leserinnen und Leser am häufigsten in die Irre geführt, deshalb hier ganz deutlich: Die Hürde zu verfehlen heißt „durch diese Studie allein nicht belegt“, nicht „falsch“ und nicht „kein Effekt“. Die Hürde ist absichtlich streng, damit Falschentdeckungen nicht in die Liste der Haupttreffer gelangen, und viele echte Zusammenhänge scheitern knapp daran, oft weil eine einzelne Studie schlicht zu klein war, um sie zu nehmen, auch wenn spätere Arbeiten den Effekt bestätigen.

Manche Ergebnisse, die die Hürde verfehlen, nehmen wir bewusst auf, und wir kennzeichnen sie immer als solche. Dafür gibt es zwei handfeste Gründe. Erstens entsteht ein polygener Risikoscore (PRS) aus der Summe vieler Varianten mit kleinem Effekt, und viele davon verfehlen einzeln die Schwelle von 5×10⁻⁸; ließe man sie weg, ginge echtes Vorhersagesignal verloren, denn die Schwelle ist ein Filter für Entdeckungen und kein Urteil über die Wahrheit. Zweitens sind die Bereiche Frontier und The Fringe genau dafür da, neue, umstrittene oder nur in einer Studie gezeigte Ergebnisse sichtbar zu machen, jeweils mit vorangestellter Angabe der Evidenzstärke. So sehen Sie den lebendigen Rand der Forschung, ohne dass wir eine erste Spur als gesicherte Tatsache ausgeben.

Pharmacogenomics (Pharmakogenetik, PGx)

Wie Ihre Gene Ihr Ansprechen auf bestimmte Medikamente beeinflussen können, auf Grundlage der Leitlinien von CPIC. Besprechen Sie Entscheidungen über Medikamente immer mit einer Ärztin oder einem Arzt.

Haplogroup (Haplogruppe)

Ein Zweig des menschlichen Stammbaums, definiert durch gemeinsame vererbte Marker. Die mütterliche Linie wird über die mitochondriale DNA verfolgt.

Literature match (Literaturtreffer)

Ein Ergebnis im Bericht: Ihre Daten stimmen mit einer Variante überein, die in einer öffentlichen Datenbank beschrieben ist. Das ist eine Information, die ärztlich zu bestätigen ist, und keine Diagnose.

Wie diese Begriffe zusammenhängen, zeigt die Seite So funktioniert die Auswertung.