Glosario

Definiciones en lenguaje sencillo de los términos que aparecen en su informe. Describen conceptos; no son consejos médicos.

El informe en sí está en inglés. Por eso cada término aparece aquí primero tal como lo leerá en el informe, seguido de la palabra en español entre paréntesis.

Variant (variante): Un punto en el que la secuencia de su ADN difiere del genoma de referencia. La mayoría de las variantes son inofensivas; unas pocas se estudian en la literatura clínica.
Reference genome (genoma de referencia, GRCh38): La secuencia estándar de ADN humano con la que se comparan los datos de todas las personas, para que una posición signifique lo mismo para todo el mundo. GRCh38 es la versión actual.
Zygosity (cigosidad): Indica si una variante está en una sola copia de un gen (heterocigota, heterozygous en el informe) o en las dos (homocigota, homozygous en el informe). En una enfermedad recesiva, es lo que separa el estado de portador de la enfermedad en sí.
Carrier (portador): Una persona con una copia de una variante recesiva. Lo habitual es que esa persona no esté afectada, pero la variante puede importar en la planificación familiar.
Pathogenic / Likely pathogenic (patogénica / probablemente patogénica, P/LP): La clasificación de ClinVar para las variantes que la comunidad científica considera causantes de enfermedad, o probablemente causantes. Repetimos la etiqueta de ClinVar; no asignamos una propia.
Review status (estado de revisión, estrellas): La escala de 0 a 4 estrellas con la que ClinVar indica cómo se revisó una clasificación. Una estrella significa que un solo envío aportó sus criterios, o que los envíos que los aportaron no coinciden; dos, que varios coinciden; tres, un panel de expertos; cuatro, una guía de práctica clínica; ninguna, que no se declararon criterios. Califica la revisión, no la gravedad de la enfermedad. Las definiciones de ClinVar. Cómo ordenan las estrellas lo que muestra un informe: las VSI, las estrellas de ClinVar y por qué puede cambiar un resultado genético.
Penetrance (penetrancia): Con qué frecuencia las personas que tienen una variante desarrollan de verdad la enfermedad asociada. Una penetrancia alta no significa certeza.
Allele frequency (frecuencia alélica): Lo común que es una variante en la población (según gnomAD). Las variantes muy raras se tratan de forma distinta que las comunes.
Genome-wide significance (significación genómica, p ≤ 5×10⁻⁸): El listón estadístico estricto que un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) tiene que superar antes de dar por real un vínculo entre una variante y un rasgo. Un GWAS analiza alrededor de un millón de variantes comunes a la vez, así que el corte habitual de p < 0,05 daría decenas de miles de falsos positivos solo por azar. Repartir ese 0,05 entre todas esas pruebas da aproximadamente 5×10⁻⁸. Si se supera, es muy poco probable que la asociación sea una casualidad estadística.
Below genome-wide significance (por debajo del umbral genómico): Un resultado que no superó el listón de 5×10⁻⁸. Aquí es donde más a menudo se confunde a quien lee, así que conviene decirlo con claridad: estar por debajo del umbral significa «no demostrado por este estudio por sí solo», no «falso» ni «sin efecto». El listón es estricto a propósito, para que los falsos descubrimientos no entren en la lista principal, y muchas asociaciones reales quedan justo por debajo, a menudo porque un estudio aislado era demasiado pequeño para alcanzarlo, aunque trabajos posteriores confirmen el efecto.

Incluimos a propósito algunos resultados por debajo del umbral, y siempre los señalamos como tales. Hay dos motivos de peso. Primero, una puntuación poligénica (PRS) se construye sumando muchas variantes de efecto pequeño, y muchas de ellas, una a una, no llegan a 5×10⁻⁸; descartarlas tiraría una señal predictiva real, porque el umbral es un filtro de descubrimiento, no un veredicto sobre la verdad. Segundo, las secciones Frontier y The Fringe existen precisamente para mostrar resultados emergentes, discutidos o de un solo estudio, con la solidez de su evidencia indicada desde el principio, para que vea el borde vivo de la ciencia sin que hagamos pasar una pista por un hecho establecido.
Pharmacogenomics (farmacogenética, PGx): Cómo su genética puede influir en su respuesta a ciertos medicamentos, según las guías de CPIC. Hable siempre con un médico antes de tomar decisiones sobre su medicación.
Haplogroup (haplogrupo): Una rama del árbol genealógico humano, definida por marcadores heredados en común. El linaje materno se sigue a través del ADN mitocondrial.
Literature match (coincidencia con la literatura): Un resultado del informe: sus datos coinciden con una variante descrita en una base de datos pública. Es información que debe confirmar con un médico, no un diagnóstico.

Para ver cómo encaja todo esto, lea cómo funciona el análisis.