Qué hacer con sus archivos de Dante Labs

Los tres archivos de su Genome Manager

Las páginas de producto de Dante prometen «acceso sin restricciones a sus archivos BAM, VCF y FASTQ», que se descargan desde el portal al que Dante llama Genome Manager. Cada uno es el mismo genoma en una fase distinta del procesamiento, y cada uno tiene un tamaño distinto.

• El VCF es la lista de posiciones en las que usted difiere del genoma de referencia, normalmente bastante menos de un gigabyte. De él salieron los propios informes de Dante, y aquí es el archivo del informe completo de 39 US$: resultados clínicos, estado de portador, la búsqueda ampliada en ClinVar sobre 1.363 genes de portador adicionales, la farmacogenética de las variantes que puede contener un VCF, los rasgos, la ascendencia y las puntuaciones poligénicas.
• El BAM contiene las lecturas alineadas, decenas de gigabytes. Registra lo que vio el secuenciador en cada posición, y por eso responde a dos preguntas que un VCF deja abiertas: si un gen se cubrió de verdad y cómo son los farmacogenes de estructura complicada, como CYP2D6. Eso es el panel Deep Read de 49 US$. No hace falta subir el BAM entero: el navegador envía solo los fragmentos que lee el panel.
• El FASTQ contiene las lecturas sin alinear. No lo usamos. Consérvelo de todos modos: ningún otro archivo permite reconstruir todo lo demás.

Dante no indica en sus páginas sobre qué versión del genoma de referencia están sus archivos, y nos han llegado archivos de Dante tanto en GRCh37 como en GRCh38, según cuándo se secuenció el genoma. Usted no tiene que hacer nada: la verificación del archivo lee la versión en el encabezado, y un archivo GRCh37 se convierte antes del análisis. Lo que lleva tiempo es esa conversión. Un VCF en GRCh38 suele estar listo en un cuarto de hora; un archivo GRCh37 grande puede tardar un par de horas.

Lo que añade una segunda lectura

Los informes de Dante son una interpretación, hecha una vez, el día en que se generaron. ClinVar y las guías de CPIC han cambiado desde entonces y siguen cambiando. Un reanálisis aquí lee el mismo VCF con las versiones actuales y fijadas de esas fuentes, imprime la versión de cada una en su informe y nombra uno por uno cada gen, enfermedad y rasgo examinados antes de que pague. Cuando el archivo no puede responder, el informe lo dice en lugar de adivinar: un VCF solo de variantes no distingue entre «usted no tiene nada» y «nadie lo miró», así que un resultado limpio de ese archivo se indica como ausente, nunca como examinado y sin nada que señalar.

El BAM cambia eso. Deep Read mide la profundidad en cada región del panel seleccionado y cuenta las bases cubiertas a 10x o más, de modo que cada gen vuelve como examinado, examinado en parte o no medido. Esas mismas lecturas resuelven el número de copias de CYP2D6, detectan dos deleciones recurrentes, tipifican HLA-DQ y alimentan el panel farmacogenético de 29 genes hasta la resolución de alelos estrella de CPIC, con un resumen final de una página que puede llevar a quien le recete los medicamentos. Si las lecturas son demasiado escasas para un gen, el panel renuncia a ese gen en lugar de determinarlo.

Dónde está hoy Dante Labs

Lo que sigue es historia, no una advertencia, y cada línea se puede comprobar. Dante Labs vendió durante años, desde Italia, secuenciación del genoma completo a consumidores, y fue para mucha gente en Europa la forma habitual de conseguir un genoma a 30x. El 23 de diciembre de 2024, el bufete Clyde & Co anunció que había asesorado a Bio Cell Tech FZCO, una empresa registrada en los Emiratos Árabes Unidos, en su adquisición de Dante Labs Genomics FZE, y que la empresa adquirida había pasado a llamarse Lifespan Genomics Labs FZCO. La web para consumidores, dantelabs.com, no menciona el cambio y sigue vendiendo la prueba a 30x.

La propia política de privacidad de Dante dice que la información genética se conserva mientras exista la cuenta y hasta tres años después de eliminarla, y que la muestra biológica se destruye tras la secuenciación salvo que usted elija guardarla. Sus preguntas frecuentes dan otra cifra para los datos personales: diez años después de la desactivación. No estamos en condiciones de conciliar las dos. La consecuencia práctica es más sencilla: las copias de sus archivos que tiene usted son las que usted controla, así que descárguelas mientras el portal las ofrezca y guárdelas en un lugar que sea suyo.

Cómo sacar sus archivos de Dante

1. Inicie sesión en su cuenta de Dante Labs y abra el Genome Manager.
2. Descargue primero el VCF. Es el archivo pequeño y el que necesita el informe completo.
3. Descargue el BAM y su índice si quiere el panel Deep Read. Es grande, así que use una conexión por cable y dele tiempo. Según las preguntas frecuentes de Dante, los archivos brutos se pueden «solicitar o descargar cuando estén disponibles»; si no le ofrecen la descarga, pídaselos a su servicio de atención al cliente.
4. Guarde los dos en un lugar privado que controle usted. No les cambie el nombre, no los descomprima ni los convierta; súbalos tal como los entregó Dante.

El proceso de descarga de Dante se describe según sus páginas públicas del 3 de septiembre de 2026 y puede cambiar; las citas están traducidas del inglés. No hablamos en nombre de Dante.

Sus archivos no salen de la UE

El tratamiento y el almacenamiento se hacen en Finlandia, con la protección que el artículo 9 del RGPD da a las categorías especiales de datos, y nada cruza una frontera de la UE. El VCF que suba se borra por defecto después del análisis; los fragmentos del BAM se borran en cuanto termina el proceso de Deep Read, tanto si salió bien como si falló. Lo que guardamos, con su consentimiento y solo si quiere un reanálisis más adelante, es un pequeño archivo de variantes normalizado que puede borrar desde su Dashboard en cualquier momento. Seguridad y sus datos.

Preguntas frecuentes

¿Cuáles de mis archivos de Dante Labs debo subir?

El VCF para el informe completo, y también el BAM si quiere el panel farmacogenético Deep Read. El FASTQ contiene las lecturas sin alinear y no lo usamos. Si no sabe qué archivo es cuál, ábralo en la verificación del archivo que hay más abajo: lee el encabezado en su navegador y le dice qué archivo es.

¿Mi archivo de Dante está en GRCh37 o en GRCh38?

Dante no lo indica en sus páginas, y nos han llegado archivos de distintos años en las dos versiones. Para la subida da igual: la verificación del archivo lee la versión en el encabezado, y un archivo GRCh37 se convierte a GRCh38 antes del análisis. Un archivo GRCh37 tarda más, hasta un par de horas si es grande.

¿Obtengo algo que no me dieran los informes de Dante?

Una segunda lectura, independiente, del mismo archivo con las guías actuales de ClinVar, ACMG y CPIC, con cada resultado atribuido a su fuente y el panel detallado por nombre antes de que pague. Con el BAM, Deep Read resuelve el número de copias de CYP2D6, indica gen por gen qué parte de cada gen quedó realmente cubierta, detecta dos deleciones recurrentes a partir de la profundidad de lectura y tipifica HLA-DQ; el panel farmacogenético de 29 genes se determina con esas mismas lecturas.

¿De quién es Dante Labs ahora?

En diciembre de 2024, el bufete que asesoraba al comprador anunció que Bio Cell Tech FZCO, una empresa registrada en los Emiratos Árabes Unidos, había adquirido Dante Labs Genomics FZE y le había cambiado el nombre a Lifespan Genomics Labs FZCO. La web para consumidores no menciona el cambio. Lo contamos porque quien decide dónde guardar una copia de su genoma tiene derecho a saber quién tiene el original.

¿Guardan mi genoma?

El archivo subido se trata y se almacena en Finlandia, y por defecto se borra después del análisis. Las lecturas del panel Deep Read se borran en cuanto termina el proceso. Nada sale de la UE, y no existe ningún depósito de genomas de Aimosti que pueda revenderse.

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