Les rapports Nebula que vous aviez payés ont cessé. Votre fichier de génome, non.

Ce que Nebula vous a donné, et ce que coûte le reste

Les conditions clients de Nebula sont précises sur les fichiers : « Vous pouvez télécharger votre fichier VCF via le portail. Si vous souhaitez obtenir votre fichier CRAM ou FASTQ, vous devrez adresser une demande au service client de Nebula », et si la demande est acceptée, « des frais de transfert de données s’appliqueront ». La plupart des clients de Nebula n’ont donc que le VCF. Ce n’est pas un problème. Le VCF est le fichier du rapport complet à 39 $US, et il pèse en général moins d’un gigaoctet.

Deux choses à savoir à son sujet. Il ne contient que des variants : il liste les positions où vous différez de la référence et ne dit rien du reste ; quand un variant lié à une maladie est absent, le fichier ne peut donc pas distinguer « rien chez vous » de « cette position n’a jamais été lue ». Nous le rapportons comme absent, et non comme examiné et sans anomalie. Et dans tous les fichiers Nebula que nous avons vus, il est en GRCh38 ; la vérification du fichier lit de toute façon la version dans l’en-tête.

Le CRAM, si vous avez payé les frais pour l’obtenir, contient les reads alignés sous forme compressée. Il répond à ce que le VCF ne peut pas dire : chaque gène du panel a-t-il réellement été couvert, et à quoi ressemblent CYP2D6 et les autres pharmacogènes à la structure difficile. C’est le panel Deep Read à 49 $US. Un CRAM ne peut être décodé qu’avec l’assemblage de référence exact avec lequel il a été écrit ; la vérification du fichier nomme donc celui dont le vôtre a besoin et vous dit si nous l’avons, avant le moindre paiement. Vous n’envoyez pas le fichier entier : le navigateur n’envoie que les tranches que le panel lit.

La profondeur que vous avez achetée détermine le niveau

Depuis le changement de marque, le même génome est vendu à trois profondeurs : la boutique de DNA Complete propose Essential à 1x, Pro à 30x et Elite à 100x, et ses conditions précisent qu’elle « ne garantit pas que chaque génome atteindra la couverture moyenne indiquée ». Le nom du fournisseur ne dit plus à personne ce que le fichier permet ; nous nous fions donc au fichier.

• 30x ou 100x : le rapport complet à partir du VCF, et Deep Read à partir du CRAM.
• 1x : un génome à faible profondeur (low-pass), c’est-à-dire un autre produit et non un produit défectueux. Ses génotypes sont déduits statistiquement à partir d’un panel de référence, ce qui convient aux origines, aux traits, à la pharmacogénétique et aux scores polygéniques, mais pas aux panels cliniques et de porteur fondés sur les variants rares. C’est le rapport à 19 $US plutôt que celui à 39 $US, et nous préférons le lire au juste prix plutôt que de refuser votre fichier : dites-nous ce que vous avez et nous le configurons.

Où en est Nebula aujourd’hui

Un historique, daté et vérifiable, et non une mise en garde. Nebula Genomics a été fondée en 2018 et a été l’une des premières entreprises à vendre au grand public un génome à 30x pour quelques centaines de dollars. Le 11 août 2021, ProPhase Labs, une société américaine cotée en bourse, a annoncé avoir racheté Nebula pour environ 14,6 millions de dollars. En 2025, l’ancienne gamme de produits a été arrêtée, et la marque vend désormais sous le nom de DNA Complete, « propulsé par Nebula Genomics, une division de ProPhase Labs » selon ses propres termes ; nebula.org affiche le site de DNA Complete. Rien de cela ne touche les fichiers existants : un VCF est un fichier texte et n’expire pas. Ce qui a changé, c’est l’interprétation pour laquelle vous payiez, et c’est cette partie que ce service remplace.

Les conditions de DNA Complete indiquent que la société « peut conserver votre échantillon et/ou l’ADN extrait après le traitement de votre échantillon », la destruction pouvant être demandée à son adresse d’assistance. Comme pour chaque fournisseur présenté sur ces pages, les copies de vos fichiers que vous détenez sont celles que vous maîtrisez.

Comment récupérer votre fichier sur le portail

1. Connectez-vous à votre compte Nebula ou DNA Complete et ouvrez l’espace de téléchargement des données.
2. Téléchargez le VCF. C’est le petit fichier, et celui dont le rapport complet a besoin. Si votre compte date d’avant le changement de marque et que le téléchargement n’est plus proposé, demandez-le à leur service d’assistance.
3. Si vous voulez le panel Deep Read, demandez le CRAM et son index (.crai) au service client ; selon les conditions de Nebula, des frais de transfert de données s’appliquent.
4. Envoyez-les ici tels qu’ils ont été livrés. Ne les renommez pas, ne les décompressez pas et ne les convertissez pas.

Les produits et les conditions de Nebula et de DNA Complete sont décrits d’après leurs pages publiques au 3 septembre 2026 et peuvent changer ; les citations sont traduites de l’anglais. Nous ne parlons au nom ni de l’un ni de l’autre.

Votre fichier ne quitte pas l’UE

Le traitement et le stockage ont lieu en Finlande, sous la protection que l’article 9 du RGPD accorde aux catégories particulières de données, et rien ne franchit une frontière de l’UE. Le VCF que vous envoyez est supprimé par défaut après l’analyse ; les reads sont supprimés dès la fin du traitement Deep Read, qu’il ait réussi ou échoué. Avec votre consentement, et seulement si vous voulez une réanalyse plus tard, nous conservons un petit fichier de variants normalisé, que vous pouvez supprimer à tout moment depuis votre Dashboard. Sécurité et vos données.

Questions fréquentes

Je n’ai que le VCF de Nebula. Est-ce suffisant ?

Oui. Le VCF donne le rapport complet : résultats cliniques, statut de porteur, l’examen ClinVar élargi à 1 363 gènes de porteur supplémentaires, les pharmacogènes qu’un VCF peut contenir, les traits, les origines et les scores polygéniques. Le CRAM ajoute le panel Deep Read et le relevé de couverture ; selon les conditions de Nebula, il est fourni sur demande moyennant des frais de transfert de données, c’est donc une décision à part.

Un fichier Nebula est-il un BAM ou un CRAM ?

Les conditions de Nebula appellent le fichier d’alignement un CRAM. Un CRAM stocke les reads sous forme de différences par rapport à un assemblage de référence précis, et ne peut être décodé qu’avec ce même assemblage ; la vérification du fichier lit celui dont le vôtre a besoin et vous dit, avant tout paiement, si nous l’avons.

Mon kit DNA Complete était l’Essential à 1x. Est-ce que ça marche ?

Oui, au niveau du rapport puce. Un génome à 1x est un génome à faible profondeur (low-pass) : les génotypes sont déduits statistiquement à partir d’un panel de référence au lieu d’être lus directement. C’est ainsi que le produit est censé fonctionner, et c’est ce qui le rend adapté aux origines, aux traits, à la pharmacogénétique et aux scores polygéniques. Il ne peut pas porter les panels de résultats cliniques et de statut de porteur, qui reposent sur des variants rares. Dites-nous ce que vous avez et nous le configurons au prix du rapport puce, plutôt que de refuser votre fichier.

Sur quelle version du génome de référence repose mon fichier Nebula ?

Les fichiers Nebula que nous avons vus sont en GRCh38, et la vérification du fichier lit de toute façon la version dans l’en-tête. Un fichier GRCh37 est converti en GRCh38 avant l’analyse, ce qui prend plus de temps.

Conservez-vous mon génome ?

Le fichier envoyé est traité et stocké en Finlande, et supprimé par défaut après l’analyse. Les reads destinés au panel Deep Read sont supprimés dès la fin du traitement. Rien ne quitte l’UE, et il n’existe pas de coffre-fort de génomes Aimosti qui pourrait être revendu.

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